Sorunuzdakiler fiil değil, sıfat, yani adjective. Sıfatlar genellikle "to be" fiiliyle kullanılır ancak istisnaları da var; "get" fiiliyle de kullanılabilir örneğin - duruma göre. Verdiğiniz örneklerdeki "of" ve "from" ise preposition. Prepositionların bir diğer kullanımı da buradaki gibidir.
Sözcükleri öğrenirken yanına gelen ekleri öğrenmek istemeniz son derece yerinde. Bunun için de ingilizce-ingilizce bir sözlük kullanmanızı şiddetle tavsiye ederim. Başta olur da zorlansanız bile zamanla alışırsınız ve son derece işinize yarayacaktır. Bu tür bir sözlük size o sözcüğün fiil mi, sıfat mı vb ne oldugu + alıyorsa aldıgı ekleri ve o sözcüğün kullanılışını gösteren örnek cümleleri gösterecektir.
Diğer sorunuza gelirsek, geçişli fiiller= transitive verbs; geçişsiz fiiller= intransitive verbs. Kullanacagınız sözlükte herhangi bir fiile baktıgınızda o fiilin geçişli mi geçişsiz mi oldugu da bir kısaltmayla belirtilir zaten.
Tümü olmasa da kısa bir liste için:
en.oxforddictionaries.com"afraid" sıfatının ardından neden "of" geliyor diye sormuşsunuz. Buna collocation diyoruz, yani kısaca bu ikisi kalıp gibi birlikte kullanılır.